Отделом патоморфологии и клинической экспертизы выполняется программа научных исследований, посвященных изучению особенностей мортогенеза при ургентной патологии различной этиологии (сердечно-сосудистая, цереброваскулярная патология, сочетанная травма, термические поражения, острые отравления суррогатами алкоголя и наркотическими ядами). Для углубленного анализа используются результаты совместного изучения материалов аутопсии и результаты прижизненного лабораторно-инструментального обследования, в т.ч. данные лучевой диагностики; биопсийный материал, результаты токсикологической экспертизы и др.
Полученные данные позволяют глубже оценить степень взаимного отягощения метаболических расстройств, системных воспалительных процессов на острую патологию жизненно-важных органов, эффективнее разрабатывать и внедрять протоколы диагностики и лечения. В арсенале отдела методы специализированных исследований и диагностики — микроскопическая диагностика поражений всех локализаций, патоморфологическая диагностика операционного материала, цитологическая диагностика и др.